Im Säugetierorganismus kann Acetessigsäureethylester (1) durch unspezifische Esterasen in Ethanol (3) und Acetessigsäure (2) gespalten werden. Acetessigsäure (2) ist ein normales Stoffwechselprodukt aus dem Fettsäureabbau und kann dementsprechend in der Zelle verwertet werden. Bei hohen Konzentrationen in der Zelle findet auch die reversible Reduktion zum 3-Hydroxybuttersäure (4) sowie die Decarboxylierung zu Aceton (5) statt. Die gleichen Abbauwege sind für Mikroorganismen zu vermuten.
Weiterer Metabolismus von Aceton (5) Metabolismusseite für Aceton. Weiterer Abbau von Ethanol (3) siehe Metabolismusseite für Ethanol.