Los mamíferos metabolizan el dietil eter (1) con participación del citocromo P450 a etanol (2) y acetaldehido (3). El etanol (2) también es oxidado a acetaldehido (3) por una alcoholdeshidrogenasa. El acetaldehido (3) puede ser oxidado fácilmente por una aldehidodeshidrogenasa para dar ácido acético (4). El ácido acético es un metabolito primario de todas las células. La vía correspondiente de degradación en los microorganismos es muy similar. El ácido acético (4) también es el último producto metabólico. Teóricamente, los grupos metilo del dietil eter también podrían ser oxidados por el citocromo P450 para dar 2-etoxietanol (5), lo que aún no se ha confirmado experimentalmente. La posterior oxidación con alcoholdeshidrogenasa y aldehidodeshidrogenasa podría formar ácido 2-etoxiacético (6), que presenta toxicidad reproductiva. Este metabolito no confirmado aún podría ser reponsable de la toxicidad reproductora del dietil eter cuando se da en dosis elevadas.