Nei mammiferi, il metabolismo della benzaldeide (1) coinvolge principalmente l'ossidazione enzimatica (aldeide deidrogenasi) del gruppo carbonilico, processo che porta alla formazione di acido benzoico (2). Questo metabolita viene quindi espulso attraverso l'urina come acido ippurico (3), dopo essere stato derivatizzato con la glicina, oppure come estere dell'acido glucuronico (4).